双通道热解吸仪在日常分析过程中，误差大小zui多10%来源于所操作仪器，而90%来源于样品的前处理好坏，或者说日常分析结果的精度90%取决于样品采集和前处理。如果样品采集和前处理比较成功，在色谱分析和数据处理时，即使选用的色谱仪所配用的检测器灵敏度不高，分析柱分离效率较低，数据处理装置性能、功能一般，也能获得比较理想的实验结果。

有时双通道热解吸仪样品未经予处理前的状态、成分复杂，在许多情况下样品不能直接进入GC分析，如：水、土壤、血液、食品、饮料、心肺等，另外有的待测组分浓度很低（环境空气中TVOC有可能低到ppb或ppt）直接进样有困难，也需要样品予处理。遇到以下情况须考虑样品予处理：

1. 品种繁多（含水、氧等）对仪器和色谱柱有不良影响；

2. 样品组成及其浓度复杂多变（基体对待分析痕量组分干扰大）；

3. 样品物理形态广（黏度、固体、多相性样品）；

4. 直接分析时，干扰因素太多；

5. 分析测试的不同质量要求；

6. 现场环境不允许，如：时间；

7. 弥补现有仪器或分析条件的不足，如：选购的仪器、设备条件不具备；操作人员的技术水平限制等。